沿革

1891年	東京顕微鏡検査所創設細菌検査業務開始
1892年	講習所開設東京顕微鏡院と改称
1894年	機関誌「顕微鏡」第1号発行東京顕微鏡学会設立
1896年	神田小川町に移転顕微鏡・種痘、細菌学など講習や顕微鏡・検温器の検定、細菌検査などを実施
1916年	機関誌を「東京顕微鏡学会雑誌」と改称
1923年	関東大震災により院舎および設備のすべてを焼失 10月1日、仮院舎にて一般業務再開
1924年	麹町区三番町に本院建築開始
1925年	新院舎にて業務を再開、脚気の治療、レントゲン講習なども実施
1927年	内務大臣より財団法人の設立許可を受ける
1940年	設立50周年記念式典挙行
1945年	戦災により焼失、以後10年にわたり事業中断
1955年	業務再開細菌検査所、診療所を開設
1967年	健康診断業務開始、外来診療業務、臨床検査業務の領域を順次拡大
1974年	旧院舎を取り壊した跡地に現在の本院を建設人間ドックを開設、付属臨床検査所を登録
1975年	食品衛生法に基づく厚生大臣指定検査機関の認可を受ける
1976年	旧多摩分室を立川に開設
1979年	水道法に基づく厚生大臣指定検査機関の指定を受ける
1981年	ビル管理法に基づき建築物飲料水水質検査業務を登録
1985年	寄付行為を抜本的に改正
1986年	再興30周年記念シンポジウム「21世紀のいのちと生活」開催
1987年	立川衛生研究所開設、学術普及誌「健康と環境」創刊
1988年	成田空港分室開設
1991年	創立100周年記念シンポジウム「21世紀への生命潮流」開催
1992年	ベイブリッジフォーラム'92「21世紀への対がん戦略」開催社団法人全国労働衛生団体連合会に加入
1993年	日本橋事務所、資料センター開設
1994年	ワークショップ「ヘリコバクター・ピロリと胃がん」開催
1995年	労働者健康保持増進サービス機関の認定を受ける
1996年	日本橋研究所開設
1997年	立川事務所及び、東久留米研究所、市ヶ谷別館を開設。産業医科大学修学資金返還免除対象機関としての「特殊健康診断実施機関」に指定
1998年	本院リニューアル完成会員制人間ドック「ヘルシーライフ・メンバーズクラブ」開始政府管掌健康保健生活習慣病予防健康診断実施機関に選定
1999年	糖尿病予防センター開設
2000年	マス・スクリーニング精度管理センター開設
2001年	日本橋研究所拡充・統合(東久留米研究所廃止) トータルヘルスセンターBe-Well! 開設 (市ヶ谷) 「女性のための生涯医療センター」（愛称ViVi）開設創立110周年記念日米メディカルシンポジウム「21世紀の女性と性（ジェンダー）と健康」開催
2002年	創立110周年記念シンポジウム「食の安全と健康を考える」開催
2003年	4月　保健医療部内を統合・拡充し、医療法人社団こころとからだの元氣プラザを設立。併せて、飯田橋に「診療所こころとからだの元氣プラザ」と「女性のための生涯医療センター」（ViVi）の2つの診療所を開設。
2004年	トータルヘルスセンターBe-Well！飯田橋開設形成外科・美容外科『魔法の森』開始
2005年	財団法人東京顕微鏡院創立115年／医療法人社団こころとからだの元氣プラザ創立3年記念シンポジウム「いのちとは何か、生きるとは何か」を開催
2007年	メディカル・シンポジウム「医療の未来、日本の未来　なぜ日本では高度先進医療が遅れているのか？」開催
2008年	遠山椿吉生誕150年、没後80年を記念して、遠山椿吉賞創設 JIS Q 15001:2006（プライバシーマーク）認証取得
2009年	「遠山椿吉記念第１回食と環境の科学賞」授与遠山椿吉生誕150年記念シンポジウム「東京の水の源流を探る～豊かな東京の水利用を支える日本の水、世界の水」開催「女性のための生涯医療センター」を「診療所こころとからだの元氣プラザ」に統合
2010年	「遠山椿吉記念第１回健康予防医療賞」授与アジュール竹芝総合健診センターの運営を受託臨床検査部がこころとからだの元氣プラザへ組織移行し、三菱化学メディエンスと共同運営で「元氣プラザ臨床検査センター」スタート
2011年	「遠山椿吉記念第2回食と環境の科学賞」授与創立120周年シンポジウム「アルツハイマー型認知症の治療・予防戦略　研究・治療・ケアの最前線から」開催
2012年	「遠山椿吉記念第2回健康予防医療賞」授与
2013年	「遠山椿吉記念第3回食と環境の科学賞」授与
2014年	「遠山椿吉記念第3回健康予防医療賞」授与登録衛生検査所「元氣プラザ細胞病理コアテクノロジー」がスタート。
2015年	「遠山椿吉記念第4回食と環境の科学賞」授与故山田和江名誉理事長・医師の50余年の功績を記念して、遠山椿吉賞50歳未満の応募者を顕彰する「山田和江賞」を創設。「元氣プラザ臨床検査センター」機能を元氣プラザビル内に移設拡充し、院内施設化。これに伴い、衛生検査所登録を抹消。
2016年	「遠山椿吉記念第4回健康予防医療賞」授与
2017年	「遠山椿吉記念第5回食と環境の科学賞」授与
2018年	「遠山椿吉記念第5回健康予防医療賞」授与
2019年	「遠山椿吉記念第6回食と環境の科学賞」授与
2020年	「遠山椿吉記念第6回健康予防医療賞」授与 ISO/IEC 27001：2013（ISMS）認証取得「診療所こころとからだの元氣プラザ」神保町に移転